tcsからigraphへ、だけど。

　本日の業務は、Tcsで作ったgmlファイル（でも拡張子は、graph）を、R(igraph）に読み込ませ、ラベルとか、ノードの大きさとか、エッジとかを自由にすること。


結論から申しますと、
Rには読み込めた！ｖ（＾＾）


・・・しかし自由にはならない・・・というところです。


昨日は、読み込みすらできなかったので、まぁ、進展したってことですかね。

ファイルが読み込めなかった原因は、おかしな小細工をしていたことで、
小細工しないで、ファイル名の拡張子がgraphのままで、read.graphを使って、ファイル形式はgmlにすればよかったのだよ、ということでした。



はぁぁぁ～。これで、すんなりデータを読みこんでくれました・・・。



くれました？

・・・じつは、くれてなかった。
（T_T)

何を読み込んでくれたのか、”属性”を確認したら、

list.graph.attributes(g)
#この場合返された結果：character(0)

list.vertex.attributes(g)
#この場合（ノードの属性）返された結果："data"      "id"        "label"     "graphics"  "vgj"   "label.cex" "size"      "color"     "shape"

list.edge.attributes(g)
#この場合（エッジの属性）返された結果："linestyle" "label"     "data"      "color"     "width"

え？ってかんじ。
Tcsでできていた”frequency”とか、” Weight ”とかはどこね？
o(ﾟДﾟ = ﾟДﾟ)o ｷｮﾛｷｮﾛ？

・・・ない。読み込めてない。
しかも、"label.cex" "size"      "color"     "shape"はRのデフォルトの数値が入っていると思われる。

さらに、vgjの中身は、””だけ、とか。


なんじゃこりゃぁ～

ヽ(｀Д´#)ﾉ ﾑｷｰ!!


うちのつつましい願いは、かなえてもらえないようです。
（・頻度に応じて、ノードの大きさを変えたい、グループごとにノードの色付けを変えたい）

いや、手打ちすれば、いーんですけどね。
しかしだね、40近くもノードがあるのに、手打ちするの？
エクセルの検索と置換とソート機能を駆使して、データを作り直すのかぃ？

・・・それは～、Rの利便性に反する、ちゅうーか、るまんどエラーが大頻発すると思われる。


とほほほほ。


そんな中でも、いろいろお世話になったHPを今日もご紹介いたします。

igraphのグラフオブジェクトの解説。とても親切です。
http://d.hatena.ne.jp/Rion778/20100406/1270553715

昨日紹介した竹本さんの解説をさらに、別の方が噛み砕いた感じの内容。
http://deta.hateblo.jp/entry/2013/05/01/053426

igraphのコマンド例。これ、これ。るまんどの場合は、これだったようです。
http://sphericalharmonics.blog110.fc2.com/blog-entry-13.html



ん～、igraphで、どこまで粘ればよいのだらおう？
( ´Д｀)=3 ﾌｩ