お絵描きがうまくできなくて、

今日の業務は、Tcsで描いたネットワーク図を美しくすること。

・・・しかし、できませんでした、というのが今日の報告です。
（T_T)


Tcsで描いたネットワーク図を美しくするにはCytoscopeというソフトを使えばよいらしいのですが、このような（自分にとって）未知のソフトに手を出すよりも、R（igraph）でできたほうが、かっこいいかもという色気が出まして、いろいろ試してみたのですが、・・・できませんでした。

ま、まったく最初の、TcsでOUTPUTされるgraph拡張子のファイルを、Rで読み込めないという現象が解決できないのでございます。

「拡張子はgraphだども、そもそもはgml形式だから」とTcsの説明書にあるので、んだらば、拡張子を書き換えればいいだけじゃんと思って、

拡張子をちょいちょいっと変えてRに読み込ませようとしたのですが、「いや知らんし、こんなファイル。ってゆーか、フォーマット違うと思う」というエラーが出てしまうのです。

OrL

あの～、これは、ｇｍｌと違うのですか？
マニュアルからとんだHPに記載されていたexampleをみる限り、違わないと思うのですよ？


とんと、わかりかねる。

( ﾟдﾟ )


そんな中でも、本日お世話になったHP

igraphのことがかなり詳しく載っています。スライドショーへのリンクもあります。
https://sites.google.com/site/kztakemoto/r-seminar-on-igraph---supplementary-information

gmlファイルのこと
http://www.fim.uni-passau.de/en/fim/faculty/chairs/theoretische-informatik/projects.html