そこからですか？のバイオインフォ～BioLinuxを入れてみた。

あ、どうも～。
報告書を書いて、ひといきついたので、BioLinuxを入れてみました。

参考にしたのはいつもの、門田先生の講義ファイルです。


すごい。門田先生のこのファイルを参考にすれば、るまんどでも、ちょっと苦労すればインストールできますよ。

苦労・・・、そう結局、ovaファイルではいろいろうまくいかなくて、isoファイルからのインストールで、何とかなりました。

さらに、なぜか、win7（ホスト）とBioLinuxでフォルダの共有がなかなかできなかったのです。先生のファイルどおりのはずなのに。でも、なんやかんややっているうちに（isoファイルからのインストール含め）、再起動とかして、いつのまにかできていました。不思議です。やれやれ。

それにしても、このBioLinuxのすごいところは、Galaxyもインストール済みなことです。すごいです。

しかし、困ったことに、BioLinuxのGalaxyには、デフォルトでtrimmomaticが入っていません。tool shodから、取り込めばいいことまではわかったのですが、なんどやっても取り込んでくれません。なぜですか？

addminの作成まではできているのに。なんかコマンドをうって、つなげる（Pathを通すってやつ）のが必要らしいのですが、「そんなファイルとかないし、知らんし」というエラーがでます。しくしく。

あ、ちなみに、BioLinuxのmanagerのPWはmanagerです。
るまんどはこれがわからずに、ずっとずっとひとりで泣いていました。
HPをちゃんと読めば書いてあります。

Start the VM and if you see a log-in screen, log in as user manager with password also manager.

 http://environmentalomics.org/bio-linux-installation/

やれやれ。