せっかく新しくするなら・・・ということで、UVとエチブロに代わる、安全な染色方法を採用することにしました。
エチブロの発がん性は、そこかしこで指摘されていることですし・・・。UVをうっかり見ちゃったら大変なことになりますし。チャンスがあれば切り替えたいな～と常々思っておりまして。
問題は、エチブロ＋UVと同等か、それ以上の感度とそれ以下のコストで賄えるものがあるのかしら～？という点です。
いろいろ探して、私がいきついたのがコレデス↓。
http://www.wako-chem.co.jp/siyaku/info/gene/article/GRGG.htm
GelGreen。なかなかよろしいです。今のところ、特に問題なく使っていますです。エチブロと比べて、そんなに感度も変わらない気がします。プレステイン(プレキャスト：ゲルにまぜて使う方法）ができるので、染色の時間が節約できるのもなかなかよろしいと思います（この辺の便利さは、使ってみて分かりました）。1万倍希釈で、0.5ｍｌ入りだから、５０mlゲルだと、１０万枚も作れます（計算あってます？）。
LEDの方は、小さくて場所を取らない（そして安価な）ものでにしました↓。こちら
http://www.mecan.co.jp/original/genetic/bi-pyra.htm
予算の範囲内で、できるだけいいデジカメをつけたのですが、やっぱり、美しさは某社のCCDカメラにかなわないかなーというところです。けど、論文のFigとしてぎりぎりOKの美しさかなと思っています。
・・・もしかしたら、カメラの設定をどこか変えたら今よりも美しくなるかも・・・。しかしどこを？
(?_?)
細かいところに多少の不便はありますが、慣れればなんてことない・・・という感じです。
-
お久しぶりです。 ご挨拶は、そこそこに、SSRのデータ解析の覚書をば（だって、ごちゃごちゃ言っている間に、忘れそうで）。 解析の流れとしては、 個体ベースでのクラスタリング（きれいな図でout put）→適切なK（集団数）の判定→集団の遺伝的距離→集団の系統樹 を示し... -
最近、自分の話をしすぎた感があるので、解析で直面したRのお話をひとつ・・・。 上のデータは、遺伝子の発現量の値だと思って下さい。cont1-3はコントロール飼育、exp1-3は実験処理をした個体です。データは、コピペコマンド（x＜-read.... -
今日の業務実績をご報告。 TCSでハプロタイプネットワークがかけました！ やったね！ ｖ（＾＾）ｖ とにもかくにも、原因は、phyファイルやNEXUSファイルが、Tcsの読めるように書けない、ということでした。原因と解決法の覚書は、以下。 ・塩基数が間違っていた→...
追記：「1万倍希釈で、0.5ｍｌ入りだから、５０mlゲルだと、１０万枚も作れます（計算あってます？）。」
返信削除↓
あってません。(-_-;)
↓
50mlゲルを作る際には、5μLのGelGreenが必要ですので、0.5ml＝500μL入りだと、100枚しか作れません。つまりこの試薬のコストは、3.1万円/100枚という計算になります。しまった、た、た、高い、かも。
(・。・;）