そこからですか？バイオインフォ：データーが大きすぎて。

さて、無事、ファイルの解凍ができたので、やぁ、もう、あとは、あれですよ、君ーにも、見え~る～、ウルトラの星～♪

Galaxyを使うんです。うふ💗💗💗💗

https://usegalaxy.org/

インストールしなくても、Wedで使える素敵なツール。「そこからですか？？バイオインフォ」の強い味方。使い方もあちこちで紹介されているし。
ちゃーんと、ユーザー登録もすませたし、データをあげるだけなんです。

あ・・・。

データをあげる？？

Σ(ﾟдﾟlll)ｶﾞｰﾝ


だめじゃん！

10GのデータをDLするのにとっても時間かかったのに、それ、またwebにあげるの無理じゃん！！！分解したって、1ファイル800Mｂあるよ？ペアエンドで倍だよ。

あたしのバカ！！！

・・・うううう。Linax構築とか、自分でできる気がしません。

R?Rなの？Rが助けてくれるの？ほんとに？

というわけで、いつもの（？）こちらのHPにお世話になることになりました。

http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html#preprocessing_filter_subset

この門田先生チームのコマンドを、ディレクトリとか変えるだけで、ほぼまんま使わせてもらいました。

とりあえず、10万リードをランダム抽出して、35Mくらいにして、Galaxyにあげられるくらいにリサイズしますです。


ふぅ。