いかにDNA抽出を安く簡単にするか!は大事なテーマだと思います。
るまんどが扱っているのは、動物なので、植物ほど「壁」は厚くないのですが、それでもタンパクだとか多糖やらをPCR系に持ち込んでしまうと、増幅を阻害されることはしょっちゅうです。
るまんどの扱っている生き物では、キア源さんは決して万能な抽出方法ではなく、24個体(8×3)を抽出(精製)したのに、バンドは1つ・・・みたいなこともありました(@_@;)。
いくら無駄にしたか?
400円かけるサンプル数、+プラスチックごみ処理費用・・・です。
そんな中、先日、実験の師匠から、「キレックス、けっこういいよ!」との伝令が!
さっそく試したところ、たしかにいいっす!
!(^^)!
なんせ、5%のキレックスを入れて、あっためたら(90℃で10~15分)抽出終了!っていう手軽さがいいです。
発売元のHPを見ますと、キレックスそのものは、キレート剤なのでPCRを阻害するタンパクたちが必要とする「金属をキレートしちゃう働きだけを持っている」そうです。
つまり、この方法は粗抽出なので、PCRだけを目的とする場合は有効だけど、きれいなDNAからいろいろやろうとする場合には、エタ沈などの作業が必要になってきます。
サンプルをどろどろにしたいときはProKと組み合わせて使ったり、長期保存の場合は精製してTE(もしくはAE)で保存するなどしてます。
なにせ、さっさとPCRしちゃうときは、そのまま使っちゃえる気軽さがいいで~す。
しかも、安いときたもんだ~♪
注)キア源さんが必ずしも万能でないというのは、るまんどの経験則(ある生物のくせ?)なので、営業妨害とかで訴えたりしないでね。扱う生物によってはかなりいいらしいので。
金曜日, 7月 31
AEの中身。
キア源さんのAEって、中身はTEだらうなぁ~と思っていたのけど、自信がなかったので調べてみました。
カタカタ~と検索してみると、キ☆ゲンさんは日本で特許を取っているということが分かりました。その申請書類の中には、
AE(10mM Tris-HCl PH9.0、0.5mM EDTA)
って、書かれてありました。おぉぉぉ。ネット社会って、すごい。
!(^^)!
るまんどが愛用している「どーじん」さんのTEは、10×TE(PH8.0)で、中身は0.1M Tris-HCl and 10mM EDTAなので、AEは、EDTAをけちってアルカリよりに調整した試薬と考えてよさそうです。
DNAは基本アルカリ中で安定だと言われていますが、PCR溶液がアルカリだと増幅を阻害する可能性もあるので、添加するテンプレートの量に気をつけないといけないかも。
あ、キア源さんと同じように扱えば問題ないのか。
これで、残ってるAEをTEのアルカリっぽいのとして有効利用できますな。
(-。-)y-゜゜゜
カタカタ~と検索してみると、キ☆ゲンさんは日本で特許を取っているということが分かりました。その申請書類の中には、
AE(10mM Tris-HCl PH9.0、0.5mM EDTA)
って、書かれてありました。おぉぉぉ。ネット社会って、すごい。
!(^^)!
るまんどが愛用している「どーじん」さんのTEは、10×TE(PH8.0)で、中身は0.1M Tris-HCl and 10mM EDTAなので、AEは、EDTAをけちってアルカリよりに調整した試薬と考えてよさそうです。
DNAは基本アルカリ中で安定だと言われていますが、PCR溶液がアルカリだと増幅を阻害する可能性もあるので、添加するテンプレートの量に気をつけないといけないかも。
あ、キア源さんと同じように扱えば問題ないのか。
これで、残ってるAEをTEのアルカリっぽいのとして有効利用できますな。
(-。-)y-゜゜゜
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